鼬的真相。企图造反的宇智波一族，以及察觉到其动作的木叶忍者村高层，鼬同时被这两边选上为间谍经过一番烦恼，最后以饶过弟弟佐助为条件，选择加入村子这一方。他成为杀害同胞的罪人离开村子，甚至没有将真相告诉他最爱的弟弟。本作新增了数个可游玩的角色，全系列最多的忍者在此集合。 以超越动画水准重新编辑鸣人与佐助的故事，还有本作才玩得到原创故事。
企图造反的宇智波一族，以及察觉到其动作的木叶忍者村高层，鼬同时被这两边选上为间谍经过一番烦恼，最后以饶过弟弟佐助为条件，选择加入村子这一方。他成为杀害同胞的罪人离开村子，甚至没有将真相告诉他最爱的弟弟。
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