大筒木因陀罗 忍术。因陀罗因父亲羽衣选择弟弟阿修罗为「忍宗」的后继者而消沉难过，日后又遭黑绝在背后煽风点火，使因陀罗对父亲与弟弟燃起增根的火焰。因陀罗否定忍宗，并创造以查克拉为武器的「忍术」，主动挑战弟弟。漫长的兄弟斗争就这么开始了。本作新增了数个可游玩的角色，全系列最多的忍者在此集合。 以超越动画水准重新编辑鸣人与佐助的故事，还有本作才玩得到原创故事。
因陀罗因父亲羽衣选择弟弟阿修罗为「忍宗」的后继者而消沉难过，日后又遭黑绝在背后煽风点火，使因陀罗对父亲与弟弟燃起增根的火焰。因陀罗否定忍宗，并创造以查克拉为武器的「忍术」，主动挑战弟弟。漫长的兄弟斗争就这么开始了。
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